用于 UCB-J PET 数据预处理的 BIDS Apps 的比较与验证
A Comparison and Validation of BIDS Apps for Preprocessing of UCB-J PET data
预印本 · 尚未经过同行评审
两种 BIDS App 与自研软件对 [11C]UCB-J PET 数据的预处理结果高度一致,但工具间存在区域依赖的偏差。
背景 正电子发射断层扫描(PET)数据的预处理可以通过许多不同的方式进行,且往往涉及手动步骤,导致不同分析和流程之间的可比性降低。基于按照脑成像数据结构(BIDS)组织的 PET 数据运行的应用程序旨在实现预处理自动化,从而能够应用标准化流程,提高可比性和可重复性。在本研究中,其中两个应用程序与内部软件进行了验证对比。方法 数据来自一项随机对照临床试验中接受安慰剂的 14 名受试者,这些受试者在内部接受了两次使用放射性配体 [11C]UCB-J 的 PET 测量。预处理使用两个 BIDS 应用程序 PETPrep 和 PICNIC,以及一个内部软件完成。动脉血数据使用 Bloodstream 处理,[11C]UCB-J 总分布容积(VT)值使用 kinfitr 通过一组织房室模型计算。结果 所有 9 个感兴趣区的 VT 值在各工具之间高度一致,一致性组内相关系数估计值介于 0.94 和 >0.99 之间,尽管以带符号百分比差异衡量的工具间偏倚存在,范围为 0.1% - 10.2%,具体取决于感兴趣区。各工具在重测指标上表现相似。我们观察到 [11C]UCB-J VT 存在来源不明的负向重测偏倚。结论 与彼此以及与针对我们内部数据处理和分析优化的内部软件相比,BIDS 应用程序均产生可靠且一致的结果。工具间依赖感兴趣区的偏倚提示在直接比较不同工具的 VT 时需谨慎。使用这些应用程序有望提高出版物之间的可比性
中文由 AI 翻译,仅供参考,以原文为准。
来源:bioRxiv · Neuroscience · biorxiv.org