活液滴单细胞RNA测序

单细胞RNA测序已成为过去十年中最具影响力的方法之一，使得解析细胞异质性以及发现稀有细胞类型成为可能。然而，大多数工作流程需要裂解细胞，并且只能提供终末快照，限制了其捕捉同一细胞内的动态细胞轨迹和时间变化的能力。在此，我们提出活液滴单细胞RNA测序（Live Droplet single-cell RNA sequencing，Live D-seq），这是一种能够对单个活细胞随时间进行可扩展的全转录组分析的技术。Live D-seq 将活体、带条形码细胞的纵向胞内采样与颗粒模板化乳化及条形码水凝胶珠相结合，使来自同一细胞谱系的重复样本能够在不同时间点之间建立关联。我们通过以下方面展示 Live D-seq 的能力：(i) 在跨物种实验中证明极低的交叉污染，(ii) 将细胞条形码精确映射到水凝胶珠条形码，以及 (iii) 追踪 A549 细胞随时间变化的上皮-间质转化动态。总之，Live D-seq 能够对同一单细胞中的基因表达进行重复、非破坏性测量，为研究健康和疾病中的纵向单细胞生物学提供了一个框架。

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