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原文
Scientific Data· Lukas Hessel, Jonas Albers, Matthias M. Gaida 等 14 人

非患病与糖尿病人类胰腺组织的同步辐射X射线数据及胰岛分割模型

Synchrotron X-ray Data of non-diseased and diabetic Human Pancreas Tissue and Islet Segmentation Model

AI 导读

发布非患病与糖尿病人类胰腺组织的同步辐射X射线三维成像数据及胰岛分割模型。

摘要 · AI 翻译

利用同步辐射微计算机断层扫描的三维虚拟组织学能够以各向同性分辨率对生物组织微结构进行无损可视化。为支持人类胰腺形态学的定量研究,我们提供了来自32名个体的55个胰腺组织芯的高分辨率三维X射线成像数据集。该数据集包括来自器官捐献者的组织学上无病变的胰腺组织,以及来自胰腺癌患者手术切除标本的非肿瘤区域,其中包含伴有胰岛素依赖型糖尿病或接受新辅助化疗后的亚组。对直径为1 mm的福尔马林固定、石蜡包埋组织芯以650 nm各向同性体素尺寸进行成像,平均有效空间分辨率为1.66 µm。该队列包括重建体积、相应的免疫组织化学、临床元数据、经专家验证的标注,以及用于朗格汉斯岛自动分割的数据集专用示例2.5D U-Net模型。一个具有代表性的配准切片获得了0.81的Dice相似系数和0.67的交并比。这一可公开获取、符合FAIR原则的资源支持对内分泌、外分泌、导管和间质结构的定量分析,并为人类胰腺组织的三维虚拟组织学和计算基准测试提供了可重复的参考框架。

中文由 AI 翻译,仅供参考,以原文为准。

来源:Scientific Data · nature.com

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