CountAnywhere：从智能手机血细胞计数板照片进行低成本细胞计数与活力检测

细胞计数决定了大多数基于细胞的实验的浓度、活力和接种密度，然而它仍然依赖于缓慢、依赖操作者的血细胞计数板计数，或者依赖于需要专用仪器和每个样本一次性计数板的自动计数仪。在此我们推出 CountAnywhere，一个基于浏览器的平台，它可以从标准血细胞计数板的普通智能手机照片中计数细胞并评估台盼蓝活力。CountAnywhere 利用图像中已有的计数网格作为标尺、对焦检查和立体学计数框，然后用一个在五种细胞系上微调过的 Cellpose-SAM 模型对细胞进行分割。微调使留出图像上的分割 F1 分数从 0.46 提升到 0.97，而一个无需拟合参数的局部对比度规则将 5,739 个手工标注的细胞分类为活细胞或死细胞，灵敏度为 98%，特异度为 99%。在 128 个血细胞计数板象限上，应用程序计数与真实值的一致性比人工计数更接近（一致性 0.999 对 0.970；平均绝对误差 5.3% 对 10.7%），并且与人工计数不同，它们不会随着细胞密度升高而向下漂移。在应用程序中完成一个完整计数池约需 50 秒，而人工计数需 122 秒。CountAnywhere 可作为公共网络应用或本地服务器运行，除标准显微镜、血细胞计数板和手机外无需任何硬件，使快速、准确的细胞计数得以普及。

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