活体空间转录组学实现纵向组织图谱绘制

空间转录组学通过保留组织中基因表达的空间背景，并使得原位研究细胞状态和相互作用成为可能，已成为生物医学研究中的一项重要技术。然而，大多数现有方法仅提供单个组织标本的静态快照，需要从不同标本中推断发育、疾病进展和治疗反应背后的分子动力学，而非在同一活体组织中进行直接追踪。在此，我们介绍活体空间转录组学（Live-ST），一种能够对活体组织进行纵向、全转录组分析的技术。Live-ST 结合基于电穿孔的细胞内采样和空间条形码，通过下一代测序在完整的活体组织中实现可重复的、空间分辨的 mRNA 测量。我们通过以下方面展示其能力：(i) 在图案化的二维细胞系统中对空间 mRNA 捕获进行基准测试，(ii) 在完整的、患者来源的活体黑色素瘤组织中空间分析转录组，同时保持组织活力，以及 (iii) 纵向追踪肿瘤微环境内的药物反应动态。总之，Live-ST 实现了对空间基因表达的可重复、非破坏性测量，为在天然生理和病理背景下研究动态组织生物学提供了新框架。

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