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原文
arXiv · Quantitative Methods· Andras Lasso, Julia Iacovell, Csaba Pinter 等 16 人
· 1 天前

用于四维血流和高维磁共振图像可视化、量化与分析的开源框架

Open-Source Framework for the Visualization, Quantification, and Analysis of 4D Flow and High-Dimensional Magnetic Resonance Images

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AI 导读

开源框架SlicerHeart实现4D flow CMR导入、可视化与量化,与cvi42测量结果高度一致。

摘要 · AI 翻译

背景:四维(4D)血流心血管磁共振(CMR)可采集心动周期内的三维解剖结构与血流速度,但当前的后处理软件为闭源、跨平台差异大,且游离于开源图像计算框架之外。我们在 SlicerHeart(3D Slicer 的扩展模块)中开发了一个开源框架,用于 4D 血流及其他高维 CMR 的导入、可视化与定量分析。方法:Import 4D Flow 读取厂商 DICOM 数据,执行预处理,并将速度存储为时间分辨的矢量场;Analyze 4D Flow 提供测量平面、流线及类多普勒可视化、分割传播与定量分析。在两者底层,我们扩展了 Insight Toolkit,使其能够存储五维及更高维数组。我们在 13 例先天性心脏病患者的 108 对配对感兴趣区中,将血流定量结果与商业软件包(cvi42)及 2D 相位对比进行了比较(Bland-Altman 分析与组内相关系数,ICC)。共识推荐的处理方法也被实现为一个开源库,并配有由解析体模、CFD 体模及临床采集数据组成的自动化测试套件。结果:这些模块与 3D Slicer 的分割、配准和渲染工具集成,并可导出速度场与几何结构用于计算建模。与 cvi42 的一致性很高:前向容积偏差 -0.1 mL(95% 一致性界限 2.2 至 -2.3;ICC 0.997),每分钟有效容积偏差 -0.015 L/min(0.21 至 -0.24;ICC 0.994)。与 2D 相位对比相比,前向容积偏差(-2.2 mL)与平均绝对百分比误差(21.8%)与 cvi42 相当(-2.1 mL;21.3%)。结论:这一开放、可扩展的框架将 4D 血流 CMR 引入了一个成熟的图像计算生态系统,并与商业参考软件高度一致;每一步均可被检查、复现与改进。

中文由 AI 翻译,仅供参考,以原文为准。

来源:arXiv · Quantitative Methods · arxiv.org

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