基于 NEST 的框架实现具有可定制亚细胞动力学的多房室神经元网络的大规模并行模拟

此前 NEST 主要模拟单房室脉冲神经元，要在网络里加入树突等亚细胞动力学需自行写 C++ 或借助面向单房室的 NESTML。作者用 NESTML 描述离子通道、受体和浓度动力学，编译成向量化 C++，配合 Hines 算法求解房室树，并沿用 NEST 的自动并行分发。在人工形态和 Blue Brain Project 模型上，其亚阈值电压与放电时刻和 NEURON 接近，300 房室时加速约 5 到 6 倍；含 2^17 个神经元的网络在每核 16 个神经元时仍接近线性加速。作者指出当前神经元分配未按模型复杂度做负载均衡。