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原文
Nature Communications· Qian-Yun Lu, Si-Qi Wang, Yan-Wen Ye 等 7 人

系统性筛选增强环状RNA翻译的RNA结合蛋白

Systematic screen of RNA binding proteins that enhance circular RNA translation

AI 导读

筛选出68个增强环状RNA翻译的RNA结合蛋白,并构建预测机器学习模型。

摘要 · AI 翻译

可翻译的环状RNA(circRNA)因其稳定性提高而带来延长的表达窗口,已成为传统mRNA疗法的一种有前景的替代方案。circRNA的翻译主要由内部核糖体进入位点(IRES)或IRES样元件驱动,并受到多种反式作用RNA结合蛋白(RBP)的严格调控。在此,我们开发了一种基于细胞的系统,用于系统筛选增强circRNA翻译的RBP,鉴定出68种蛋白为非经典翻译的推定激活因子。这些翻译激活因子参与广泛的生物学过程,包括RNA加工、核糖体生物发生和翻译起始。我们进一步设计了一种机器学习算法,以提取这些激活因子的共同序列特征,并预测更多具有翻译激活因子活性的潜在RBP。随后,新鉴定和预测的激活因子被验证能以情境依赖的方式促进IRES介导的circRNA翻译。总体而言,本研究为IRES相关的反式作用因子提供了新见解,并扩展了RNA合成生物学中工程化RBP的工具箱。

中文由 AI 翻译,仅供参考,以原文为准。

来源:Nature Communications · nature.com

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