炎症刺激后脑与肾脏细胞外囊泡形态及互补性脑蛋白质组学

形状、大小变异和蛋白质组成描述了组织细胞外囊泡（EV）制备物的不同特性。我们使用透射电子显微镜（TEM）比较了脑和肾EV的形状与大小。我们还评估了重复的蛋白质检测，并重新分析了一个已公开的脑蛋白质组学队列，并注明其原始来源。该研究使用了脑室内注射脂多糖（LPS）和一种静脉注射的miRNA相关EV制剂。每组包含三个生物学样本，如源数据中所标注。来源形态计量学摘要包括385个脑和101个肾的轮廓。对照组、LPS组和治疗组的肾圆形度分别为0.9225、0.8977和0.9288。直径四分位离散度（一种大小变异的度量）的相应值分别为0.2603、0.5334和0.6018。因此，接近对照的轮廓形状与持续存在的大小变异并存。经Holm校正后，六项主要形态学检验均不再显著。独立重算在各项单独检索中确认了1,527个符合条件的大鼠蛋白质登录号。完整的定量矩阵包含953个特征。主要肽段过滤器结合了唯一肽段和特异肽段。更严格的分析保留了916个特征。PTGFRN和LAMB2仍然是仅有的显著的治疗对比LPS的发现。在主要分析中，PTGFRN增加了14.71倍（q = 0.0365），LAMB2增加了6.23倍（q = 0.00585）。它们的LPS水平已接近对照值。探索性归一化使用了四种测得的EV相关标志物的几何均值。由此得到的治疗对比LPS的增加分别为16.43倍和6.96倍。这些比值支持回收混合物中相对蛋白质呈现的选择性变化。它们并未确定每个EV的蛋白质拷贝数。对完整蛋白质谱的分析以及对完整选择过程的校准并不支持整体恢复到对照水平。本研究将形态学和组成作为独立结局进行比较。它将膜和基质关联确定为优先验证事项。原始TEM测量数据不可获得，样本匹配仍未解决，且缺乏肾脏蛋白质组学数据。这些局限性妨碍了因果结论以及形态学与蛋白质组成之间的个体样本比较。

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