整合蛋白质组学分析揭示不同形式脑积水的共享分子特征
Use of Integrative Proteomic Analysis to Uncover Shared Molecular Signatures Across Distinct Forms of Hydrocephalus
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跨研究蛋白质组分析发现,不同病因脑积水共享炎症、TLR信号、血脑屏障破坏与神经元损伤相关蛋白改变。
脑积水是一种异质性疾病,以脑脊液(CSF)动力学紊乱为特征,可由多种病因引起,包括出血后脑积水(PHH)、蛛网膜下腔出血(SAH)后脑积水、感染后脑积水(PIH)以及特发性正常压力脑积水(iNPH)。脑积水在儿童和老年人群中疾病负担高,且患病率随年龄增长而显著上升。尽管发病率如此之高,其潜在的分子和信号通路改变仍未被完全理解。因此,CSF蛋白质组学分析将为探索疾病特异性生物标志物以及发现脑积水共有的分子机制提供稳健且高分辨率的方法。在本研究中,我们进行了跨研究蛋白质组学分析,以评估在PHH、SAH、PIH和iNPH组中报道的生物标志物蛋白。利用已发表的蛋白质组学数据集,我们比较分析了CSF蛋白,以研究各脑积水组中的差异表达蛋白(DEPs)、其共同的分子特征以及富集的生物学通路。跨病因来看,反复改变的蛋白主要与炎症信号(细胞因子、趋化因子、白细胞介素-(IL-17)、肿瘤坏死因子(TNF))、Toll样受体(TLR)信号、导致凝血级联反应的血脑屏障(BBB)破坏以及神经元损伤反应相关。出血相关型脑积水(PHH和SAH)表现出富集的凝血和血红蛋白相关通路,而感染相关型(PIH)则表现出增强的免疫和炎症反应。iNPH表现出与神经退行性变、突触功能和CSF清除受损相关的蛋白改变。有趣的是,我们的跨研究分析识别出在脑积水各亚型中反复失调的蛋白。总之,我们的跨研究蛋白质组学分析界定了脑积水各亚型中共有和病因特异性的蛋白质组学特征,并识别出用于诊断分层和未来精准治疗方法的潜在CSF生物标志物。
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来源:bioRxiv · Neuroscience · biorxiv.org