全小鼠脊髓多尺度空间转录组图谱

脊髓通过多样的神经元和非神经元群体协调感觉、运动与自主功能，然而分子定义的细胞类型如何在其全长范围内组织起来仍不完全清楚。本文中，我们使用 Stereo-seq 生成成年小鼠全脊髓的全基因组、单细胞分辨率空间图谱。通过对跨越颈、胸、腰和骶段的 81 个解剖学配准横断面中的 322,827 个细胞进行分析，我们解析出 12 个主要细胞类别和 94 个转录组亚簇。主要细胞类别占据沿吻尾轴保守的特征性解剖区域，而各个亚簇则表现出可重复的层状、内侧-外侧及节段相关分布。全转录组分析识别出协调的空间基因表达模块，这些模块独立于预定义的细胞类型标签勾勒出解剖结构域。值得注意的是，少突胶质细胞亚型在脊髓各节段的脊髓白质内表现出独特且可重复的层状组织，揭示了超越传统解剖描述的更精细结构分区。将细胞类型身份与局部空间组织整合进一步定义了层级结构域，这些结构域既重现了经典解剖结构，又在既有区域内解析出更精细的分区。总之，这些发现定义了一种多尺度的细胞构筑，将转录组多样性、空间基因表达程序与整个脊髓的解剖组织联系起来。

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