Science Advances· Samir Lalani, Samuel Haddox, Kendall Bromley 等 14 人
· 1 天前
整合性发现与功能依赖性图谱揭示活跃转录组中的关键嵌合RNA
Integrative discovery and functional dependency mapping uncover essential chimeric RNAs in the active transcriptome
AI 导读
研究构建1019个癌细胞系中569,640个嵌合RNA图谱，并鉴定出对细胞过程必需的功能性嵌合RNA。
摘要 · AI 翻译
嵌合RNA是一类被定义为含有多个基因遗传信息的RNA转录本的分子。尽管其在不同组织类型和疾病状态下的表达模式已被充分记录，但这些转录本的生物学功能仍知之甚少。在本研究中，我们开发了一套整合预测流程，构建了涵盖1019个癌细胞系中569,640个嵌合RNA的图谱。利用这一资源，我们通过将预测结果与癌症依赖图谱项目的扰动数据集整合，开展了系统性的功能依赖性筛选。该方法超越了单纯预测，识别出对细胞过程至关重要的高置信度功能性嵌合RNA，其中包括由相邻基因顺式剪接产生的一组复发性嵌合转录本。我们证明，敲低选定的候选嵌合体可破坏细胞周期进程和细胞适应性，且这些转录本在原发乳腺肿瘤中频繁失调。总之，这些结果表明嵌合RNA构成了一个此前未被充分认识的表观表达层，将功能基因组扩展至传统遗传学之外。
中文由 AI 翻译，仅供参考，以原文为准。
来源：Science Advances · science.org