bioRxiv · Neuroscience· Cimen, H., Sonmez 等 6 人
整合转录组元分析揭示帕金森病中 SIRT1-SNCA 相关性
Integrative Transcriptomic Meta-Analysis Reveals SIRT1-SNCA Correlation in Parkinson's Disease
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AI 导读
整合33个数据集发现白藜芦醇在所有比较中均被检出,SIRT1-SNCA关系随模型而异。
摘要 · AI 翻译
帕金森病(PD)是一种进行性神经退行性疾病,影响中脑多巴胺能神经元,目前尚无获批疗法。在某一模型中鉴定出的候选分子靶点,并不总能在用于研究PD的尸检脑组织、诱导多能干细胞(iPSC)和细胞模型中追溯验证,这使临床转化变得复杂。为弥补这一缺口,我们对33个公开数据集进行了整合转录组荟萃分析,涵盖PD的尸检人脑、iPSC衍生模型和多巴胺能细胞系。差异表达和功能富集分析与STRING蛋白-蛋白相互作用网络相结合,随后针对多酚面板进行药物-基因相互作用筛选。总体而言,白藜芦醇在所有33项比较中均被检出,与模型系统、组织和遗传背景无关。我们将白藜芦醇与30个不同的靶基因相关联,而SIRT1本身在跨越全部三种模型系统的6项比较中即为被检出的靶点。最后,我们将SIRT1-SNCA关系解析为四种方向性模式,这些模式因模型而异:在尸检脑组织中呈反向关系,而在急性毒素暴露的细胞中呈正向关系。这些发现支持PD中存在一个候选的、情境依赖的白藜芦醇-SIRT1轴。
中文由 AI 翻译,仅供参考,以原文为准。
来源:bioRxiv · Neuroscience · biorxiv.org